1999年，由于数码世界资料异常增生，导致数码世界和现实世界的连接发生紊乱。地球上相应地出现奇怪的自然现象：东南亚没有下雨，池塘全部干涸；中东却因为连场大雨发生洪水；美国则遇到有史以来最寒冷的冬天。 11岁的少年八神太一（藤田淑子 配音），和伙伴石田大和（风间勇刀 配音）、武之内空（水谷优子 配音）、泉光子郎（天神有海 配音）、太刀川美美（前田爱 配音）、城户丈（菊池正美 配音）、高石武（小西寛子 配音）一起参加了夏令营，一次意外却被神秘地送到了一个多彩的数码世界。在那里，他们得到了叫做“数码宝贝”的搭档。进入数码世界后，八神太一一行人遇到了凶恶的怪兽贝壳兽，眼看大家都要被抓住的时候，太一的亚古兽忽然进化成为暴龙兽，拯救了他们。进化到底是怎么回事情？数码世界究竟是什么？无数的谜团出现在被召选的小朋友们面前，精彩的冒险就这样开始了……
企鹅影视和炎央文化联合出品，讲述了异界仙岛上神族少年与凡人少女步步惊心、险境迭起的东方绮梦。
故事讲述两派来到地球后，因为发生了一些“事件”，导致双方外形大变（也解释了两系列风格不同的原因）。也由于这些“事件”，变形金刚要隐藏于人类社会之中。如何去平衡一切关系是擎天柱作为领袖将要面临的考验，本作品的标题也由此而来。 值得一提的是，本次两派领袖 擎天柱 和 威震天 的配音者是久违的梦幻组合：来自初代动画的 Peter Cullen 和 Frank meijubar.net Welker！他们在阔别电视版的变形金刚作品多年后，再次一起回来共演这双经典的死对头！
因经历过核冬天，在这里人类不再是世界的主宰，物种变异、生存资源稀缺，面对无法预测的未来和环境，危机迭出。人类为了保护自己建造了一座座壁垒，但也有很多人没有进入壁垒生活，在荒野打猎为生。主人公任小粟和弟弟颜六元就是其中之一。并无血缘关系但却相依为命的兄弟二人凭借着他们顽强的意志力不断成长，并在偶然的机会下觉醒了超能力。任小粟为生计和保护家人，离开自己生活的集镇前往境山，一路遭遇狼群、人面虫、变异生物的袭击，觉醒超能力，任小粟能否在危机中逃生...
