突袭世界的大灾难“第二次冲击”后，世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他，却见到名为“ 使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下，特务机关NERV的葛成美里将真嗣救下，并将其带往碇元渡所统领的NERV总部。但迎接真嗣的，却是是父亲冷酷地命令：驾驶称为“EVA”的巨大人型机器人与使徒战斗。本已表示拒绝的真嗣，看到重伤的替补驾驶员绫波丽后，决定遵从父亲的命令。就这样，从未受过作战训练的真嗣，准备驾驶EVA初号机迎战使徒。 不断袭来的使徒，身份不明的绫波丽，从德国来的驾驶员惣流·明日香·兰格蕾，14岁的少年要面对远超自己能力的挑战。而碇元渡不动声色地观察一切，一个称为“人类补完计划”的神秘计划正在按照他的计划实现。
2022年，一场未来战争在少数人类幸存者和无穷无尽的机器大军之间激烈进行了数十年。1997年，被称为“天网”的人工智能获得了自我意识，并向人类开战。 一名被送往过去改变人类命运的士兵被夹在未来和过去之间。她来到1997年，任务是保护一位名叫马尔科姆·李的科学家。这位科学家致力于推出一种新的人工智能系统，以对抗“天网”即将对人类发出的攻击。马尔科姆一面应对其发明所涉及的复杂的道德问题，一面遭到来自未来的无情杀手的追杀，而这永远改变了他三个孩子的命运。
“我想成为你的诱饵……！”故事关于一个男装女孩和一个宠爱她的吸血鬼之间略带危险的同居生活。BL=Bloody Love！
