1999年，由于数码世界资料异常增生，导致数码世界和现实世界的连接发生紊乱。地球上相应地出现奇怪的自然现象：东南亚没有下雨，池塘全部干涸；中东却因为连场大雨发生洪水；美国则遇到有史以来最寒冷的冬天。 11岁的少年八神太一（藤田淑子 配音），和伙伴石田大和（风间勇刀 配音）、武之内空（水谷优子 配音）、泉光子郎（天神有海 配音）、太刀川美美（前田爱 配音）、城户丈（菊池正美 配音）、高石武（小西寛子 配音）一起参加了夏令营，一次意外却被神秘地送到了一个多彩的数码世界。在那里，他们得到了叫做“数码宝贝”的搭档。进入数码世界后，八神太一一行人遇到了凶恶的怪兽贝壳兽，眼看大家都要被抓住的时候，太一的亚古兽忽然进化成为暴龙兽，拯救了他们。进化到底是怎么回事情？数码世界究竟是什么？无数的谜团出现在被召选的小朋友们面前，精彩的冒险就这样开始了……
秦灭汉起，百废待兴。诸子隐世，氏族势行。驱车逐鹿，弱肉何争？同心携力，主臣兼行。天命赐异，源于甘星，施于阴阳，异于静动。静者天行，缓而止争；动者袍泽，速若雷霆。捕星之计，谋策之心。甘星入世，衍造异人。奸者祸国，忠者祸身，道貌离合，莫再成臣。离经叛道，天下重分。采薇采薇，复始如周，采薇采薇，复始若秦。
