灰太狼受神秘人袭击后被抓走，小羊们根据蛛丝马迹将他寻回，却发现灰太狼眼神变得空洞呆滞，疑似大脑受到损伤。为解救同伴，喜羊羊带着伙伴们借助灰太狼发明的“脑波机”进入到灰太狼的大脑世界，他们在脑海里一个个光怪陆离的区域中历险，同时也认识到很多新的朋友，帮助他们探求真相找寻让灰太狼恢复正常的方法。大家历尽艰险眼看真相快要浮出水面了，不料灰太狼突然陷入昏迷，更大的危机正步步逼近……
经历了第一季和第二季的种种状况，莱德带领的汪汪队越战越勇！莱德队长接到任务，新一季的挑战马上拉开帷幕！帮小精灵实现愿望，去北极搭救北极熊宝宝，帮助外星人修理太空飞船，汪汪队总能出色完成任务！更值得期待的是，在一次救援行动中，一只大耳朵狗狗Tracker机智英勇地帮助汪汪队完成任务，而受邀成为汪汪队新成员！
