1999年，由于数码世界资料异常增生，导致数码世界和现实世界的连接发生紊乱。地球上相应地出现奇怪的自然现象：东南亚没有下雨，池塘全部干涸；中东却因为连场大雨发生洪水；美国则遇到有史以来最寒冷的冬天。 11岁的少年八神太一（藤田淑子 配音），和伙伴石田大和（风间勇刀 配音）、武之内空（水谷优子 配音）、泉光子郎（天神有海 配音）、太刀川美美（前田爱 配音）、城户丈（菊池正美 配音）、高石武（小西寛子 配音）一起参加了夏令营，一次意外却被神秘地送到了一个多彩的数码世界。在那里，他们得到了叫做“数码宝贝”的搭档。进入数码世界后，八神太一一行人遇到了凶恶的怪兽贝壳兽，眼看大家都要被抓住的时候，太一的亚古兽忽然进化成为暴龙兽，拯救了他们。进化到底是怎么回事情？数码世界究竟是什么？无数的谜团出现在被召选的小朋友们面前，精彩的冒险就这样开始了……
故事发生在一个科技十分发达的星球之上，宅博士（邓玉婷 配音）是一名杰出的机械师，一次偶然中，他激活了五个散落在星球各处的超人，之后，这些超人们成为了保护星球和平的正义使者。 活泼开朗，天真正直的开心超人（刘红韵 配音）、聪明大胆，温柔可靠的甜心超人（邓玉婷 配音）、天性爱美，实力强大的花心超人（严彦子 配音）、稀里糊涂，丢三落四的粗心超人（祖晴 配音）和沉默寡言，外冷内热的小心超人（刘红韵 配音），五个各具特色的小小超人所要面对的，是来自灰心星球的大大怪（高全胜 配音），面对如此强大的敌人和敌人们惹出来的一堆大大小小的麻烦，这五个小家伙真的没问题吗？
