《克拉波波利斯》以神话中的古希腊为背景，讲述了一个由人类、神和怪物组成的功能失调的家庭试图管理世界上第一批城市的故事——也就是说，他们没有试图杀死彼此。
故事从一名高中生叙述而开始，五岛桐绘和她的男朋友斋藤秀一以及住在这个受诅咒的黑涡镇的人们，面对着一连串围绕在漩涡相关的诅咒和超自然事件当中，而这座小镇的秩序也即将失控。
