故事发生在东京八丈岛近海，一座将全球各地警方监控相连接的高科技设施——“太平洋浮标”即将启动。为了与欧洲刑警组织管辖的范围联网，来自世界各地的工程师聚集在这里。基于人脸识别的全新“黑科技”也正在测试中……与此同时，柯南一行人前往八丈岛观鲸，途中柯南接到冲矢昴（赤井秀一）的电话，被告知欧洲刑警组织成员在德国遭到琴酒的杀害。为调查真相的柯南潜入“太平洋浮标”。正当工程师们正在为系统启动而展开准备工作时，一桩案件突然发生！一名女工程师被黑暗组织绑架，她手中存有核心技术的U盘也落入了黑暗组织手中！此时，水下传来未知潜水艇逼近的声音，令人毛骨悚然，一个神秘的黑影也正在悄悄接近灰原哀……
自从阿伯拉罕（Kris Kristofferson 饰）被吸血鬼带走，日行者刀锋（韦斯利?斯奈普斯 Wesley Snipes 饰）就没有停止寻找这位父亲一样的老搭档，并终于在东欧将其救出。阿伯拉罕缺席的日子里，刀锋依靠新伙伴斯加德担任后勤支持。 不久吸血鬼长老派人传递停战协议，只因吸血鬼中出现了新的变种——收割者，收割者同时以人类和吸血鬼为食，而且由于过快的新陈代谢导致他们需求惊人。刀锋为保全人类同意带领由长老之女内纱（Leonor Varela 饰）、雪人（甄子丹 饰）等组成的吸血鬼血帮部队，消灭收割者，但岂料这一切是吸血鬼的阴谋……
