主角·城茂的朋友沼田五郎为邪恶组织·黑撒旦所杀，为了复仇，城茂只身潜入黑撒旦的基地，并假装自愿接受改造手术，成为电气人。但因为手术时城茂偷偷拿掉催眠装置，所以他并未被洗脑。在向大首领宣誓的时侯，城茂趁机逃脱。 在逃脱的时侯，城茂救出了被改造成电波人的岬百合子，之后两人便与黑撒旦和迪鲁扎军团的奇械人、改造魔人展开了战斗。
在这一季里，超级飞侠们都升级成为了愿望守护者 。 在新的一季中，超级飞侠们将摇身一变成为勇敢的愿望守护者，他们不仅拥有酷炫的新装备，同时每个超级飞侠都拥有不同属性的能量球。 在遇到困难需要帮助时，呼叫愿望守护者，启动愿望守护者程序，超级飞侠会带着不同的能量球，启动能量球，加入愿望守护，共同解决面临的阻碍与困难。 愿望能量球可以给超级飞侠和孩子们相同的强大力量去武装来完成伟大的事情，每个愿望能量球蕴含来自于我们身边的自然世界中不同的超强能量，它们是旋风、水波、大地、钢铁、动物、闪电、火焰等能量。 愿望守护者的任务是为小朋友们排忧解难帮助小朋友们实现他们的美好愿望。
