ヒャッコクジムのジムリーダー・ゴジカに勝利し、7つ目のジムバッジを入手したサトシ達は8つ目のポケモンジムがある街・エイセツシティに向けて、旅を続けていた。その道中、一行は正体不明のポケモン「プニちゃん」を旅に連れていくのだが、「プニちゃん」は謎の集団・フレア団に狙われていた。 击败了第七道馆的道馆训练家葛吉花后，小智一行人继续以收集齐八枚徽章为目标向映雪市进发。在旅途中，他们遇到了正体不明的绿色生物“小软”（基格尔德·核心）及为其目标而行动的神秘团体“闪焰队”。
混杂于群众之中，以人类的肉为食。 拥有人类的形态， 却与人类不同的存在……“喰种”。 对“喰种”进行驱逐、研究的CCG， 为了达成某个命题， 而新设了实验体集团。 ——其名为“Quinx”。 并非“正经人类”的他们， 与佐佐木琲世一等搜查官一起 在“东京”面对的事物究竟是——！？ 描绘《东京食尸鬼√A》2年后的新章《东京食尸鬼:re》终于启动。
该剧主要围绕于愤世嫉俗的疯狂科学家瑞克·桑切斯和他容易受挫折的外孙莫蒂·史密斯在自己的生活和其他异空间穿梭的奇妙冒险。
