真新镇的少年年满10岁之后，就可以得到训练神奇宝贝的资格。10岁的少年小智（松本梨香 配音）以成为最厉害的神奇宝贝训练大师为目标，即将踏上了修行之旅。小智因为早上赖床迟到，险些失去挑选神奇宝贝的资格，无奈下他领走了一只被挑剩下的神奇宝贝——皮卡丘（大谷育江 配音）。皮卡丘又名电气鼠，虽然长相可爱，但性格含羞内向却又不亲近人类，稍有不满就乱放电电人，暴躁的脾气让小智吃尽了苦头。大木博士把神奇宝贝图和宝贝球作为践行礼物送给了小智。在小智和皮卡丘的前方，神奇宝贝的世界有许多谜题和探险在等着他们，迎接他们的到底是光明还是黑暗，小智能否如愿成为神奇宝贝大师呢？
花季少女表白温柔女前辈，谁曾想前辈竟然是男生！？ 女装男子花冈真琴某日放学后收到了一封匿名信，“又是误以为我是女生的学弟的告白吧”，原本这么想的他遭到一年级女生苍井咲突如其来的告白。 在真琴坦白了自己是伪娘后，咲非但没有失望反而狂喷鼻血：“简直太完美了，这代表我能同时享受男生版和女生版的前辈了！” 虽然真琴还是拒绝了咲，但咲并未放弃，而是下定决心更要主动出击追到真琴！
