本季中邪恶的女王曼多拉将孔雀和罗丽抓回仙境，为救出同伴，各位主角将再次闯入仙境。女王控制的仙境更加危险，能否救出同伴我们还将拭目以待。本季中全新角色琪娜将会登场，她拥有神秘娃娃菲灵，并有着独特的战斗技能。她能否击败水王子和封银沙阻止邪恶女王的计划吗？
新战国时代，忍者们展开着与妖怪们激烈的战斗。以战斗末了，猿飞佐助为首的5人的忍者们，在自无敌将军们三神将被给予的「封印的门」中关锁妖怪总司令和妖怪们的能源的，事上成功了。丢失能源并在人类社会融洽了的妖怪カッパは，欺骗猿飞佐助的子孙佐助和雾隐的子孙才藏，使之开了东京湾有了的封印的门。注视了祖先世世代代封印的门的血统的少女鹤姫决定与去除了封印的佐助与才藏，三好入道清海的子孙清海，并且从美国来的见雷也的子孙见雷也的4人一起，同500年前的祖先同样进行妖怪封印。一边经营绉纱衬衣铺，一边持续妖怪封印的旅行。
命运，它会让你出乎意料，让你开心，展现你的长处，或是摧毁你的自信心，揭露你的过错，让你质疑自己，命运是个混蛋，但我们其中少数的幸运儿能够掌控自己的命运，将其导向善良、公平、正义。 第三季，机械之声将继续寻找六件上古神器中剩下的两件，并与五色龙议会展开最终决战。他们能否打破命运束缚，拯救王国？
