真新镇的少年年满10岁之后，就可以得到训练神奇宝贝的资格。10岁的少年小智（松本梨香 配音）以成为最厉害的神奇宝贝训练大师为目标，即将踏上了修行之旅。小智因为早上赖床迟到，险些失去挑选神奇宝贝的资格，无奈下他领走了一只被挑剩下的神奇宝贝——皮卡丘（大谷育江 配音）。皮卡丘又名电气鼠，虽然长相可爱，但性格含羞内向却又不亲近人类，稍有不满就乱放电电人，暴躁的脾气让小智吃尽了苦头。大木博士把神奇宝贝图和宝贝球作为践行礼物送给了小智。在小智和皮卡丘的前方，神奇宝贝的世界有许多谜题和探险在等着他们，迎接他们的到底是光明还是黑暗，小智能否如愿成为神奇宝贝大师呢？
天生拥有“冰火同源”体质的融念冰，自小被冰神塔追杀，跳崖明志后被“鬼厨”查极所救并收为徒，悟到“以魔入厨”的奥义。只身来到冰雪城后，一边精进厨艺，一边苦修魔法，念冰惊人的实力初现端倪。然而，危机接踵而至，念冰是否能化险为夷，成为仰光大陆顶级魔法师？
