真新镇的少年年满10岁之后，就可以得到训练神奇宝贝的资格。10岁的少年小智（松本梨香 配音）以成为最厉害的神奇宝贝训练大师为目标，即将踏上了修行之旅。小智因为早上赖床迟到，险些失去挑选神奇宝贝的资格，无奈下他领走了一只被挑剩下的神奇宝贝——皮卡丘（大谷育江 配音）。皮卡丘又名电气鼠，虽然长相可爱，但性格含羞内向却又不亲近人类，稍有不满就乱放电电人，暴躁的脾气让小智吃尽了苦头。大木博士把神奇宝贝图和宝贝球作为践行礼物送给了小智。在小智和皮卡丘的前方，神奇宝贝的世界有许多谜题和探险在等着他们，迎接他们的到底是光明还是黑暗，小智能否如愿成为神奇宝贝大师呢？
虚无，世界最大的灾难。人类只能联合同盟对抗来自虚无的怪物“祝福者”。大陆边境沙洲成为了抵御入侵的重要防线，却有一个名为“祝福之影“的黑暗势力欲寻找被尘封的力量。同盟领袖国度黑岛派出精锐尖兵白狼御伽，意欲摧毁闹事的黑暗势力，却因为一名虚无出来的神秘少女珊瑚的乱入，沙洲变得风起云涌。命运的红线，交织着众人的信念，准备揭开在虚无中隐藏的历史真相。少女与少女超越信念的宿命对决，浪漫奇谭正式展开。
