故事发生在一座民风淳朴风景秀美的小镇之中，曾经，天空上出现的巨大黑色圆盘令人们陷入了恐慌之中，但除此之外大家的生活却并未受到实质性的影响，世界依旧在照常运转着，久而久之，人们渐渐习惯了被圆盘笼罩的生活。
　　古宫乃乃香（夏川椎菜 配音）跟随着父亲回到了曾经的故乡圆盘之街，在那里，乃乃香遇见了曾经的玩伴们。个性孤僻沉默寡言的户川汐音（小松未可子 配音）、活泼开朗的看板娘椎原小春（佳村遥 配音）、对圆盘的存在十分反感的水坂柚季（丰崎爱生 配音）和她的哥哥水坂凑太（石川界人 配音），当失落的回忆再度被记起，当告别的朋友们重新相聚，命运的齿轮开始了它的转动。

　　地纹明日汰（花江夏树 配音）是一名平凡的初中二年级男生，某日，离家出走的他偶然遇见了名为星宫凯特（久野美咲 配音）的女孩，星宫凯特虽然长了一副萝莉般的可爱身材和面孔，其真实身份却是企图征服世界的秘密组织“星”的首领。在阴差阳错之下，地纹明日汰被卷入了“星”的战斗之中，成为了一名战斗员。
　　腹黑高傲的抖S女鹿羽逸花（伊濑茉莉也 配音）、生得碧眼金发却一口广岛腔的娜塔莎（花泽香菜 配音）、机器人罗伯子（山崎惠理 配音），组织里的最底层生物亚斯（鸟海浩辅 配音），加入“星”后，这些稀奇古怪的角色们接二连三的出现在了明日汰的身边。

　　故事发生在风景秀丽民风淳朴的流川市，宇佐美奈奈子（伊藤美来 配音）是生活在那里的一名平凡的女高中生。市里新建的游泳池即将完工开门营业，奈奈子和朋友们越好到时候一起去玩。奈奈子想要一件新的泳装，无奈价格昂贵她只能向妈妈求助，然而妈妈却拒绝了奈奈子的请求，一时之间，奈奈子感到无计可施。
　　就在这个节骨眼上，在市政厅工作的奈奈子的叔叔太田（室园丈裕 配音）替奈奈子找了一份工作，奈奈子可以用打工赚来的钱去买泳衣了！就这样，在误打误撞之中，奈奈子竟然成为了流川市的当地偶像，并以此身份开始了一系列的宣传表演活动。

　　圣诞之夜，卡森共和国水企业和哈里曼达拉公司签订协议的大厦门外，无数群众声讨抗议。而就在此时，担任护卫的警察机动部队突然掏枪对示威群众展开无差别屠杀。血腥恐怖的事件背后，神秘病毒“火种”若隐若现。在与不明敌人对决过程中，草薙素子（坂本真绫 配音）和独立机动部队的同伴们救下了全身义体的少女津田艾玛（茅野爱衣 配音），其身上似乎隐藏着利用虚拟记忆进行恐怖活动的事实。公安9课课长荒卷大辅（塾一久 配音）拒绝将其交给陆军情报部穗积上校（庆长佑香 配音），而是命令草薙将艾玛护送至501机关接受调查。草薙在少女身上不仅发现两个灵魂的存在，更触摸到了被官方、军方可以隐藏的悲惨真相……
　　本片根据士郎正宗的原作改编，为攻壳机动队前传“ARISE”的第四部。