动画分为三个短篇。
　　《一碗乡愁》：青年小明（坂泰斗 配音）独自一人离开故乡来到大城市北京打拼，掐指一算，他已经很久没有回去过了。某日，小明拖着疲惫的身躯去往上班的路上，忽然怀念起了家乡的味道。往事伴随着思念渐渐浮现。
　　《霓裳浮光》：依琳（寿美菜子 配音）和璐璐（白石晴香 配音）是两个生活在广州的年轻女孩，无依无靠的她们相互扶持，将彼此视为自己的亲人。依琳曾经是一名红极一时的人气模特，但现如今，她能够很明显的感觉到自己的事业正在走下坡路。巨大的压力之下，她只有将情绪发泄到离自己最近的璐璐的身上，两人之间产生了隔阂。
　　《纤雨初晴》：故事发生在1990年代的上海，李墨（大冢刚央 配音）和夏小雨（长谷川育美 配音）是青梅竹马的玩伴，两人的友谊一直持续到了中学时代。然而，当李墨离开了故乡去别的城市上学之后，这段友谊便画上了句点。

　　在人与妖怪之间过着忙碌日子的夏目，偶然与以前的同学结城重逢，由此回忆起了被妖怪缠身的苦涩记忆。此时，夏目认识了在归还名字的妖怪记忆中出现的女性·津村容莉枝。和玲子相识的她，现在和独子椋雄一同过着平稳的生活。夏目通过与他们的交流，心境也变得平和。但这对母子居住的城镇，却似乎潜伏着神秘的妖怪。在调查此事归来后，寄生于猫咪老师身体的“妖之种”，在藤原家的庭院中，一夜之间就长成树结出果实。而吃掉了与自己形状相似果实的猫咪老师，竟然分裂成了3个——！？

　　小镇盗窃案频频发生，一只梦想成为大侦探的猫咪为了找出真凶决定离家出走。旅途中的她遇到了一只自认风度翩翩的公鸡，一只梦想成为马戏团明星的驴，一只仇恨人类的守门狗。四只小动物历经磨合，即将找出真凶时，却被误认为是偷窃真凶。他们该如何证明清白，如何守护友谊和梦想……

　　比第一季好看 至少逻辑上更合理了 就是好喜欢boss baby的眼睫毛啊 我的天 P.s 这季里stacy真的就是个潜在的反派角色 超级耀眼！

　　世界的崩溃开始了。
　　暴走的大缅因猫兽吸收了黑暗进化的迪路兽、
　　用强大的力量进化成了秩序兽。
　　根据世界树的想法，现实世界将被数码世界所吞噬。
　　在绝望迫近的时候，被选中的孩子们拼命地向前。
　　现在太一不在了，能代替他带队的只有大 和。
　　「为了拯救世界，我们还有必须要做的事情！」
　　加布兽的话给大和带来了活力，而亚古兽则坚信太一定会回来。
　　另一方面，恒常性要处置失去控制的秩序兽、
　　并尝试施行干涉现实世界的最终计划。
　　为了阻止毁灭的到来，被选召的孩子们和他们的搭档拼命地战斗。
　　「所有的光芒，都汇聚在了缅因猫兽…」
　　绝望的迪路兽向大家说到。
　　孩子们做出最后决定的时候到了。
　　被选中的孩子们，自己将选择怎样的未来？
　　现在，冒险将再一次进化。