故事开始于卧底警察潜伏黑帮，意外的坐上了黑帮老大的位置，不料被大毒枭设计一步步拖入公海的魔鬼运输船；恰逢此时，一支神秘的第三方部队正在展开他们的复仇之路，命运的纠葛从此开始。在三方力量的角逐中，激烈的搏斗、刀战、枪战、狙击战、遥控炸弹，层层升级步步惊心。在法与情，爱与恨，兄弟和女人之间，有些事情总要有人去做。
中国警方在得到线报，获得以九子龙为首的国际制毒贩毒集团在大陆开辟的黄金通道——云南经广州，深圳至香港，进行全方位清理。贩毒集团的首领九子龙也被抓获，但经审查，被抓的人并不是九子龙！九子龙已经逃脱了法网，在此情况下，公安部缉毒局召回内线侦察员 “火狐”命令他继续留在香港，查清九子龙的下落。 九子龙在遭受打击之后，并没有潜藏起来，而是开辟了新的贩毒通道，把位于东海沿海的龙海市作为跳板，市公安局缉毒大队长王小波是闻名的缉毒英雄。他在获取毒团伙将在珍珠岛渡假村进行毒品交易的情报后，率领缉毒警包围了渡假村。但现场情况却出乎他的意料，毒枭麻三和几个日本买主全部昏倒在餐桌旁。王小波擒获了贩毒人员并缴获冰毒三千克，五百万美金毒资不翼而飞……… 为九子龙顶罪而入狱的曹东方因刑出狱而得到九子龙的重用，九子龙的干女儿阿丽和男友号称亚洲第一制毒手阿西在接曹东方出狱时遇上黑道...
《罪案现场实录第六季》，拟直接采访案件的亲历者，及参与破获案件的侦查员；亲历案件的当事人作为案件的讲述人；他们将客观地道出一段段破获案件的解密细节，披露案件破获背后鲜为人知的亲历故事。
