在未来世界里，人类研发出了生理上与人类无异的仿生人，二者唯一差别就是可以被植入“初始执念”。由于该产业发展迅猛，有人开始利用其进行非法活动。政府最终出台“仿生人禁止令”。 政府成立“明眸搜查部”来配合搜查混迹在人类社会中未被发现的仿生人，调查员程诺（宋威龙 饰）和安秋（文淇 饰）在组长万国峰（祖峰 饰）的带领下展开工作。二人从开始的互看不惯到后来可以默契配合完成案件侦破。就在这个过程中，二人各自隐藏的秘密也渐渐浮出水面。
蛰伏的无限者为了获得“抑制剂”的配方不断派出异能者作案，多次袭击异能局成员。望帝利用被洗脑的沈梦，大举进攻异能局。面对来势汹汹的无限者，异能局众人同心合力，与无限者斗智斗勇，解决了一次次的危机。然而一心想篡位的周蝶也在蠢蠢欲动谋划了一场更大的阴谋……
