一心想成为幽灵猎人的天空寺尊于18岁生日时，收到来自十年前亡父生前所寄的幽灵眼魂（Ghost Eyecon）后，来自异世界的怪人——眼魔突如其来地出现在面前并盯上此物，甚至为救青梅竹马月村明里和御成而身亡。得到仙人的帮助之下而获得Ghost驱动器变身，成为假面骑士Ghost并得以九十九日短暂的生命复苏。为收集实现复活愿望的「15位伟人」眼魂，投身于影响世界命运的战斗中。
传奇黑客为拯救人类被系统AI追杀身死，意外成为异界第一宗门的宗主，但为了应对宗内全是卧底的局面和随身而来的系统危机，陈宁只想低调的再观望看看。但如锥处囊中，纵使他冷面无双心系世人，也是万花丛中过，朵朵都沾身，最后在系统代理人姜雀的帮助下，陈宁王霸之躯一抖，敌我双方纳头便拜！世界隐秘争先恐后对他打开，最终破解灭世危机。
回过神来，我只身一人站在地平线的中央。 环顾身边，没有任何的建筑物和人影。 束手无策地踱步之时，突然矗立在身后的「黄昏旅店」… 那是，存在于生与死之间的旅店。 为什么无法动弹？ 为什么……是我？ ――这是赌上性命的第二次比赛。
