《赛尔号之圣者逆袭》是《赛尔号》动画片的续集。讲述的是2110年，地球能源已接近枯竭，环境污染日趋严重。 为了实现地外星系探索计划，人类制造了名为赛尔的机器人，并建造能源探索飞船赛尔号，寻找传说中的无尽能源。可就在找到无尽能源的时候，无尽能源被宇宙海盗欧比组织摧毁，赛尔们不得不去寻找藏在宇宙深处，由谱尼看守的第二个无尽能源……
曾折断无数同龄球儿之心的、日本第一的初中生投捕组合·清峰叶流火和要圭，面对来自全国74所名门高校的热情挖角，竟然悉数拒绝、从此销声匿迹……并且出现在一所普通到不能再普通、且没有棒球部的都立高校？背后的原因，竟然是因事故失忆的要圭？ 在不应相遇之处、相遇的天才们——！
